Formar doctores(as) que puedan comprender y resolver problemáticas educativas asociadas a la formación docente y los procesos de aprendizaje. Contribuir al desarrollo académico, científico y profesional en las Ciencias de la Educación, para el estudio de problemas educacionales en contextos interculturales.

Formar doctores en el área de las ciencias sociales competentes para diseñar y conducir investigaciones que contribuyan a generar nuevo conocimiento y a resolver problemas de la sociedad, incorporando la vinculación con el entorno y la socialización del conocimiento como aspectos relevantes.

Formar investigadores de nivel avanzado en el ámbito de la filosofía, la religión y las distintas tradiciones científicas y humanistas del pensamiento contemporáneo, favoreciendo una mirada interdisciplinar.

El programa de Doctorado en Ingeniería tiene como objetivo principal el formar capital humano avanzado en Ciencias de la Ingeniería, siendo éste capaz de abordar problemas de complejidad en las áreas de Sistemas Inteligentes y Reconocimiento de Patrones, Sistemas Silvoagrícolas Digitales, y Bioingeniería en Ambientes Naturales y Modificados, desarrollando soluciones basadas en la ciencia y tecnología.

Formar capital humano avanzado que contribuya a la generación de conocimiento científico que permita comprender de manera integrada el impacto del cambio climático y la degradación ambiental sobre la salud de los sistemas naturales, asumiendo el estrecho vínculo entre la salud humana y otras comunidades biológicas, con el medioambiente.

Formar capital humano avanzado realizando investigación multidisciplinar con potencial de ser transferida a la sociedad, respondiendo a las necesidades de la región y el país, resultando en bioprocesos, bioproductos y servicios aplicados a las áreas de agroindustria avanzada, alimentos funcionales, medio ambiente y biomedicina en un contexto de sostenibilidad.